Зачем биомедикам понадобился свой язык описания онтологий, как эти задачи решает BioCypher и при чем здесь Neo4j: практическое приложение Data Science и графовых алгоритмов в биомедицинской сфере. Что такое BioCypher Графовые алгоритмы активно применяются в биомедицине для анализа различных биологических данных, таких как геномные, протеомные, данные о белковых взаимодействиях и...
Сегодня заглянем внутрь Neo4j, чтобы разобраться с базовыми концепциями этой графовой базы данных. Какие уровни изоляции транзакций поддерживаются в Neo4j, почему одна установка по умолчанию содержит две базы данных, что такое составная БД и как с этим работать. Транзакции в Neo4j Neo4j — это популярная нативная графовая СУБД, способная управлять...
Что представляет собой паттерн проектирования микросервисов под названием источник событий (Event Sourcing) и как его реализовать в реляционных базах данных и NoSQL-системах. Разбираемся с архитектурой данных и архитектурой ПО на практических примерах. Архитектурный шаблон Event Sourcing Многие архитектурные шаблоны рассматривают сущности (entity) как основную концепцию, описывая способы их сохранения и...
Что такое безиндексная смежность и как она снижает сложность алгоритмов обхода графа, позволяя быстро и эффективно запрашивать множество узлов и отношений. Разбираемся с уникальными принципами работы графовых баз данных на примере Neo4j. Архитектура и принципы работы графовых баз данных Несмотря на стремление разработчиков современных СУБД к унификации их решений, первичная...
Чтобы показать еще один вариант использования графовой базы данных Neo4j, сегодня реализуем небольшое Python-приложение, которое генерирует граф знаний в облачной платформе Aura DB. Ищем финансовые переводы между компаниями и физическими лицами, считаем общую сумму и визуализируем найденные транзакции с помощью библиотеки Networkx. Python-приложение для работы с Neo4j в AuraDB Как...
Инкрементные конвейеры загрузки больших объемов данных в корпоративное хранилище или озеро как самый экономичный способ масштабирования архитектуры данных. Разбираемся, как дата-инженеру эффективно организовать такие ETL-конвейеры. 2 способа организации конвейеров инкрементной загрузки данных Инкрементный ETL (Extract, Transform and Load) для классического DWH стал обычным явлением с источниками CDC (сбор данных об...
Сегодня решим логистическую задачу поиска кратчайшего пути, создав граф знаний в Neo4j, развернутой в облачной платформе Aura DB и визуализируем найденный путь с помощью Python-библиотеки Networkx. Работа с Neo4j в AuraDB В прошлой статье мы упоминали, что для работы с популярной графовой СУБД Neo4j совсем необязательно устанавливать ее локально. Можно...
Как реализовать гибридную архитектуру данных Lakehouse на новой платформе Chango с движком обработки распределенных запросов Trino без дополнительного развертывания кластера Kafka и разработки Spark-приложений потоковой передачи событий. Что такое Trino: принципы работы распределенного SQL-движка О том, что представляет собой новая гибридная архитектура данных под названием Lakehouse, мы подробно писали здесь,...
Что такое потоковая аналитика больших данных, какие бывают СУБД потоковой передачи, когда и зачем их использовать, а также что влияет на выбор этих инструментов хранения и аналитической обработки Big Data. Что такое потоковые базы данных и как они работают Мы уже упоминали, что аналитика данных в реальном времени может быть...
Недавно мы писали про резидентную графовую СУБД Memgraph, которая хранит данные в оперативной памяти. Сегодня рассмотрим, как выгрузить граф знаний из Memgraph на диск с помощью библиотеки GQLAlchemy, а также поговорим про персистентность другого популярного NoSQL-хранилища Redis, которое также является резидентным, но относится к семейству key-value. Как сохранить данные из...
Как Lakehouse объединяет пакетную и потоковую обработку, какие проблемы возникают при реализации этой гибридной архитектуры данных и каким образом они решаются с помощью Delta-подхода и Apache Spark Structured Streaming. Краткая история появления дельта-архитектуры от лямбда- и каппа-моделей Мир больших данных постоянно развивается: появляются новые технологии и архитектурные шаблоны. В частности,...
Что общего у Apache HBase с Google Bigtable, чем они отличаются и какую NoSQL-СУБД выбирать для практического использования. Чем похожи NoSQL-хранилища для больших данных Apache HBase часто называют Google BigTable для Hadoop, поскольку она обеспечивает аналогичные возможности и использует многие концепции этой облачной NoSQL-СУБД. В частности, именно Bigtable был выпущен...
В рамках продвижения нашего нового курса по графовым алгоритмам в бизнес-приложениях сегодня познакомимся с графовой резидентной СУБД Memgraph и сравним ее с Neo4j, определив достоинства, недостатки и варианты использования в задачах аналитики больших данных. Memgraph vs Neo4j Memgraph — это высокопроизводительная графовая СУБД с открытым исходным кодом, которая хранит и...
Сегодня на примере Apache HBase и Redis разберемся со сходствами и отличиями NoSQL-СУБД типа «семейство колонок» и «ключ-значение». Что между ними общего и что выбирать для практического использования в зависимости от сценариев применения. 3 типа NoSQL-хранилищ данных Apache HBase и Redis являются довольно популярными базами данных среди NoSQL-решений. Однако, они...
Что общего у Neo4j с TigerGraph и чем они отличаются: разбираемся с популярными графовыми СУБД и их возможностями для аналитики больших данных в рамках продвижения нашего нового курса по графовым алгоритмам в бизнес-приложениях. Сравнение Neo4j с TigerGraph Подробно об архитектуре, принципах работы, функциональных возможностях и вариантах использования TigerGraph мы писали...
Зачем биотехнологической платформе Polly от Elucidata понадобился API SQL-запросов в облачном сервисе Elasticsearch и как дата-инженеры реализовали его, развернув Delta Lake с AWS Atnena и S3. Что не так с SQL-запросами в облачном Elasticsearch на AWS Ежедневно биотехнологическая платформа Polly от Elucidata обрабатывает гигабайты биомолекулярных данных для биологов по всему...
Продолжая разговор про языки запросов к графовым базам данных, сегодня познакомимся с GSQL, который поддерживается в MPP-СУБД TigerGraph. Как работает эта распределенная NoSQL-база данных и каким образом реализует ACID-требования к транзакциям в операциях с графами. Архитектура и принципы работы графовой MPP-СУБД TigerGraph — это распределенное графоориентированное хранилище данных с массивно-параллельной...
Как реализовать CDC для Delta Lake: разбираемся с функцией Change Data Feed от Databricks, которая позволяет быстро узнать обо всех изменениях строк в дельта-таблицах озера данных. Польза и принципы работы CDF для дата-инженера и архитектора данных. CDC для Delta Lake Идея сбора и обработки не всего объема данных, а только...
Использование СУБД вместо очереди сообщений считается антипаттерном, однако, команда разработки облачной системы организации конвейеров обработки данных Dagster Cloud выбрала PostgreSQL вместо Apache Kafka для регистрации событий. Разбираемся, почему плохой шаблон принес хорошие результаты и что нужно учитывать при выборе технологии. Почему не стоит использовать СУБД вместо очереди сообщений Dagster Cloud...
Вопрос перестройки логистических цепочек сегодня стал очень остро перед множеством предприятий, от малого до очень крупного бизнеса. Рассмотрим, как методы Data Science и аналитики больших данных помогают бизнесу справиться с современными вызовами на примере реализации алгоритма Дейкстры в библиотеке Graph Data Science графовой СУБД Neo4j. Постановка задачи: поиск кратчайшего пути...